Il lavoro scientifico dell’Istituto si riflette nelle sue pubblicazioni. L’attività editoriale dell’Istituto è iniziata pochi anni dopo la sua fondazione, nel 1962, con la pubblicazione della rivista scientifica annuale “Thesayrismis” e la pubblicazione del catalogo della collezione di icone dell’Istituto compilato da Manolis Hadjidakis (Icônes de Saint-Georges des Grecs et de la collection del’Institut Hellénique de Venise).
Dal 1962 ad oggi l’Istituto Ellenico ha 48 volumi di “Tesori” e più di 100 edizioni di libri distribuiti nelle varie collane dell’opera editoriale come Biblioteca, Elleno-Latino Anatolico, Fonti, Conferenze, Thomas Flanginis, Rapporti, ecc.